Ahhoz, hogy egy cég megfelelően és zavartalanul működhessen, szükség van szakszerű könyvelésre is. A könyvelés manapság már programok segítségével zajlik, melyek leegyszerűsítik és felgyorsítják a folyamatot. A bérszámfejtés szorosan kapcsolódik a vállalkozások könyveléséhez. Bármilyen meglepő is egyesek számára a bérek számítása, azok kontírozása elengedhetetlen és szerves részét képezi a cég életének. A könyvelésről általánosságban elmondható, hogy minden pénzmozgással járó folyamat idetartozik, amely egy cég működése során történik.

Ezáltal ide értendő a bérek számítása, a kimenő és bejövő számlák iktatása, az éves eredménybeszámoló elkészítése, a mérleg és a főkönyvi könyvelés is. Ezek bizony nem hiányozhatnak egy cég életéből sem. Ha pedig a bevételi és a kiadási adatok nem egyeznek egymással, akkor vélhetően hiba történt a könyvelés során. Így a bérszámfejtés sem jól készült el. Ezt pedig sürgősen korrigálni szükséges. Az adóhatóság által kirótt büntetések igen nagy mértéket képesek ölteni.